化学发光成像系统的工作原理主要基于化学发光反应。具体来说，当特定的化学物质与待测样品中的目标分子发生反应时，会释放出能量并产生荧光或发光现象。这种发光现象是由于化学反应中电子的激发和跃迁所产生的。

在化学发光成像系统中，先选择适当的化学发光反应体系和相应的化学染料或标记物。这些染料或标记物通常是荧光染料或放射性标记物，它们能够与目标分子发生特异性结合。当这些化学物质被引入到待测样品中时，通过适当的刺激方式（如光激发、温度变化或电子激发等）触发化学发光反应。

一旦化学发光反应发生，产生的荧光或发光信号会被成像设备捕捉和记录。这些成像设备通常包括荧光显微镜、摄影机、荧光扫描仪等，它们具有高灵敏度和高分辨率，能够检测到微弱的发光信号。

成像设备会将捕捉到的发光信号转化为数字信号，并通过计算机进行处理和分析。通过图像处理软件，可以对发光信号进行定量和定位分析，从而得到关于目标分子在样品中的分布、浓度等信息。

需要注意的是，化学发光成像系统的工作效果受多种因素的影响，如反应条件、化学发光体系的选择、成像设备的性能等。因此，在实际应用中，需要根据具体的实验需求和样品特性来优化系统参数和实验条件，以获得准确、可靠的成像结果。

综上所述，化学发光成像系统通过利用化学发光反应产生的发光信号，结合高灵敏度的成像设备，实现了对生物样品中目标分子的定量和定位分析，为生物学和医学等领域的研究提供了有力工具。