化学发光凝胶成像系统的原理基于化学发光技术和凝胶电泳技术的结合。先，样品经过凝胶电泳分离，目标分子被固定在凝胶中。接着，凝胶被浸泡在含有化学发光底物的溶液中，底物与目标分子发生反应，产生化学发光信号。这些信号随后被高灵敏度的成像系统捕捉并记录下来。

具体来说，化学发光反应通常包括两个步骤：化学反应和发光反应。在这个系统中，常用的化学发光反应是基于荧光素酯（luciferin）和荧光素酶（luciferase）的。荧光素酯是一种无色的化合物，在荧光素酶的作用下，发生氧化反应，产生荧光素和CO2。荧光素是一种发光物质，它在荧光素酶的作用下，发生发光反应，产生蓝色的光。

另外，成像系统通常采用的是CCD（Charge-Coupled Device）成像技术。CCD是一种光电转换器件，它能够将光信号转化为电信号，从而实现对化学发光信号的捕捉和记录。

综上所述，化学发光凝胶成像系统通过结合化学发光和凝胶电泳技术，实现了对生物大分子的有效、灵敏的检测和成像，为生物学和医学等领域的研究提供了有力的工具。