北京企业申请ISO9001认证的流程如下：

前期准备

- 制定推行计划：包括体系诊断、成立小组、文件编写、审核等内容及时间安排。

- 成立推行小组：确定成员及分工，明确“管理者代表”和“推行小组组长”。

- 组织相关培训：对小组成员培训，让员工了解推行工作内容及自身职责。

体系建立

- 文件结构策划：确定编写计划、进度及文件内容。

- 确定条款删减：遵循不影响客户要求和产品质量责任的原则。

- 确定文件编写格式：制定质量手册、程序文件等的封面、内页等格式规范。

- 确立各过程流程：绘制涉及多部门的流程，确保衔接顺畅。

- 编写各类文件：编写程序文件、质量手册、三级文件及四级文件(表单)，并进行审查和发布。

体系运行与完善

- 文件宣传培训与试运行：培训员工了解体系文件内容，试运行并记录、讨论出现的问题，优化文件和流程。

- 内部审核培训：确保至少有2人具备内审证，对相关人员进行内部审核培训。

- 次内部审核：按程序编写计划、检查表，实施审核并填写不符合报告等。

- 管理评审活动实施：制定年度和当次计划，准备相关资料，召开会议并输出报告。

- 内部质量体系补审：对内部审核、管理评审进行专项审核。

认证申请与审核

- 认证申请：体系完善改进运行三个月后，向选择好的认证机构提交申请。

- 接受外审：包括文件审核和现场审核，企业提前准备并按计划接待审核。

- 现场审核不符合项纠正：针对不符合项进行原因分析，实施纠正和纠正措施。

获得证书

在认证后的4-6周，企业若通过审核，即可获得认证机构颁发的ISO9001认证证书。